Юрий Павлович окончил Грозненский нефтяной институт в 1961 г., Ленинградский инженерно-строительный институт (ЛИСИ) в 1965 г., работал в тресте ;Липецкпромстрой; мастером, прорабом, главным инженером.
Вся научная и педагогическая деятельность профессора Ю.П. Панибратова связана с СПбГАСУ, где он прошел путь от аспиранта до заведующего кафедрой экономики строительства, ректора (1990-2005).
Инженер, педагог, учёный, крупный специалист в области экономики и организации строительства, эффективности инвестиций в строительную отрасль, управления проектами. Он внес значительный вклад в решения актуальных проблем строительства, особенно на Северо-Западе России. Один из организаторов и участник экономического эксперимента по совершенствованию управления инвестиционным процессом, осуществляемого правительством РФ в ряде регионов. Создал новую комплексную программу непрерывной экономической подготовки студентов и подсистему «Капитальное строительство» АСУ Росминвуза (внедрены во многих регионах России). Участвует в международных экономических программах и конференциях, тесно связан с учеными Великобритании, Германии, Финляндии, Польши, Словакии.
Автор и соавтор более 200 научных и учебно-методических работ, в том числе монографии, учебники и учебные пособия. Имеет патенты и авторские свидетельства на изобретения. За учебник для вузов «Управление в строительстве» (2-е изд.: М., 2001) удостоен премии Правительства РФ в области образования за 1998 г.
Действительный член Международной академии наук высшей школы, Международной академии инвестиций и экономики строительства, Международной инженерной академии, Международной академии наук экологии и безопасности жизнедеятельности, Российской инженерной академии, Петровской академии наук и искусств. Председатель Научного совета РААСН по проблемам экономики в области архитектуры, градостроительства и строительных наук, член диссертационных советов при СПбГАСУ.
Награждён орденом Почёта (1997), орденом «За заслуги перед Отечеством» IV и III степени (2002), орденом «За заслуги перед Отечеством» III степени, медалями «За трудовую доблесть» (1971) и «В память 300-летия Санкт-Петербурга» (2003). Лауреат Государственной премии РФ в области науки и техники (2001), почётный ректор СПбГАСУ (2007).